A Diretoria do Colégio João XXIII de Bento Ribeiro é composta por:
Direção Geral
Coordenação Geral
Direção Administrativa
Secretária Administrativa
Direção Pedagógica
Diretora Substituta
Orientação Pedagógica/SOP
Orientação Educacional/SOE
Supervisora Operacional Bloco A
Supervisora Operacional Bloco B
Secretária Escolar
Além da Diretoria, o colégio dispõe de:
Secretária do SOE/SOP
Agente de Comunicação Social
Agente de Tesouraria
Agentes administrativos
Direção Geral – Exercida por um padre escolhido pela Mitra.
Coordenação Geral – Coordena todos os trabalhos e a operacionalidade do colégio em todas as áreas.
Direção Administrativa – Coordena os trabalhos inerentes ao setor administrativo, ou seja, estrutura física do colégio, documentação, apoio ao ensino, etc.
Secretária Administrativa – Suporta e apóia as operações determinadas pela direção administrativa.
Direção Pedagógica – Coordena todas as operações ligadas ao ensino.
Diretora Substituta – Substitui eventualmente a direção pedagógica.
Orientação Educacional / SOE – Dá suporte e faz o atendimento aos alunos e pais no que concerne à aprendizagem e relacionamento social dentro do colégio.
Orientação Pedagógica / SOP – Dá suporte às operações de ensino notadamente aos professores, elaborando regras, normas, técnicas e procedimentos pedagógicos.
Supervisora Operacional Bloco A – Supervisiona todas as operações de ensino do prédio A, assessorando alunos, pais e professores num primeiro momento. Caso não consiga solucionar deverá encaminhar ao SOE/ SOP.
Supervisora Operacional Bloco B – Supervisiona todas as operações de ensino do prédio B, assessorando alunos, pais e professores num primeiro momento. Caso não consiga solucionar deverá encaminhar ao SOE/ SOP.
Secretária Escolar – Elabora, controla, distribui e arquiva toda a documentação dos alunos e da instituição.